Para poder colocar la respuesta automáticamente por encima del texto al que respondes, deberás editar las plantillas por defecto del editor. Para eso, en Settings → Composer → *Standard Templates, *o sus equivalentes en español, deberás cambiar todas las plantillas de respuesta para que el comando %CURSOR aparezca por encima del comando %QUOTE.

Por ejemplo, la plantilla de responder a todos pasaría de ésto:

%REM="Default reply all template"%-
On %ODATE %OTIMELONG %OFROMNAME wrote:
%QUOTE
%CURSOR

A ésto:

%REM="Default reply all template"%-
%CURSOR

On %ODATE %OTIMELONG %OFROMNAME wrote:
%QUOTE

Deberás cambiarlas todas. Y para más inri, si usas KMail como un plugin de Kontact, probablemente debas cambiar estas plantillas en ambas aplicaciones; por alguna razón no hablan entre ellas muy bien. En cualquier caso, ese cambio funciona una vez ambos escenarios reconocen el cambio.

Siendo esta aplicación parte de KDE, entorno de escritorio famoso por la ingente cantidad de opciones que ofrece, que falte algo tan básico es casi un síntoma de la falta de diseñadores de producto colaborando con proyectos de software libre que, por otro lado y desde cualquier punto de vista, son fantásticos.

Aún así, no hace falta buscar muy a fondo en internet para encontrar respuestas como la que sigue:

No tiene nada de malo que la comunidad de KDE eduque a usuarios como tú en conceptos avanzados de los clientes de correo electrónico [como las plantillas]. … … entender cómo funcionan las plantillas de texto no es mucho pedir para un usuario de KDE/Plasma. Siempre puedes instalar Thunderbird si piensas diferente.

Y así es como el software libre pierde usuarios: con respuestas pedantes que piensan que forzarte a perder el tiempo con algo tan de nicho como un lenguaje de marcado específico de un editor de plantillas de mensajes correo electrónico es más razonable que mejorar un producto con una opción en forma de una casilla de verificación. Una triste casilla de verificación.